第1章 代謝組學概述 001
1.1 非靶向代謝組學 003
1.2 靶向代謝組學 011
1.3 擬靶向代謝組學 014
參考文獻 017
第2章 代謝組學的基本操作 019
2.1 樣本前處理 020
2.2 樣本檢測 024
2.3 數(shù)據(jù)預處理及統(tǒng)計分析 032
2.4 生物標記物的篩選 040
2.5 化合物鑒定 041
2.6 代謝組學研究中常用的數(shù)據(jù)庫 048
2.7 代謝組學活性篩選 057
2.8 小分子代謝物如何發(fā)揮重要功能 059
2.9 活性小分子代謝物的篩選方法 063
參考文獻 065
第3章 代謝組學研究中應記錄的關鍵信息 069
3.1 樣品前處理 070
3.2 樣本檢測 072
3.3 數(shù)據(jù)預處理與統(tǒng)計分析 073
3.4 化合物鑒定 075
3.5 化合物命名 076
3.6 小結 078
參考文獻 079
第4章 代謝組學相關資料 080
4.1 有助于實驗設計的參考文獻 081
4.2 代謝組學實驗中應該如何做選擇? 081
4.3 質譜相關知識 083
4.4 高分辨液質聯(lián)用技術的發(fā)展 090
4.5 質譜使用注意事項 095
4.6 代謝組學數(shù)據(jù)處理時如何去除外源性物質干擾 096
4.7 實驗過程中需要注意的問題 097
4.8 送公司測試樣本 102
參考文獻 105
第5章 代謝組學常用軟件操作 107
5.1 如何用 Origin軟件畫質譜圖 108
5.2 SIMCA軟件操作 117
5.3 MetaboAnalyst軟件操作 123
5.4 HemI軟件操作 137
5.5 MS-DIAL軟件操作 142
5.6 MZmine2軟件操作 151
第6章 總結 166
6.1 代謝組學并不神秘 167
6.2 代謝組學的學習過程 169
附錄 172
附錄一 代謝組學知識框架圖 173
附錄二 血液樣本的代謝組學研究方法 174
附錄三 尿液樣本前處理方法 175
附錄四 組織樣本前處理方法 175
附錄五 代謝組學樣本前處理和分析方法 176