β-內(nèi)酰胺酶和其它機制介導(dǎo)的細(xì)菌耐藥

第一篇抗菌藥物與細(xì)菌耐藥機制 1
第一章抗菌藥物的發(fā)展與作用機制 2
第一節(jié)名詞來源2
第二節(jié)抗菌藥物的發(fā)展概況3
第三節(jié)抗菌藥物作用機制簡介4
參考文獻6

第二章β-內(nèi)酰胺類抗生素的發(fā)展和作用機制 7
第一節(jié)β-內(nèi)酰胺類抗生素的分類7
第二節(jié)β-內(nèi)酰胺類抗生素的發(fā)展史9
第三節(jié)β-內(nèi)酰胺類抗生素的作用機制11
參考文獻18

第三章細(xì)菌耐藥機制 19
第一節(jié)常見病原菌的耐藥機制19
第二節(jié)特殊的抗菌藥物耐藥機制21
第三節(jié)結(jié)語25
參考文獻25

第四章β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥機制概述 27
參考文獻30

第五章PBP改變介導(dǎo)的耐藥 32
第一節(jié)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌32
第二節(jié)腸球菌36
第三節(jié)肺炎鏈球菌38
第四節(jié)革蘭陰性病原菌41
第五節(jié)結(jié)語41
參考文獻42

第六章外膜通透性改變介導(dǎo)的細(xì)菌耐藥 45
第一節(jié)革蘭陰性菌外膜蛋白概述45
第二節(jié)孔蛋白的功能特性和種類47
第三節(jié)孔蛋白的結(jié)構(gòu)特征48
第四節(jié)孔蛋白與細(xì)菌耐藥49
第五節(jié)常見病原菌孔蛋白
改變介導(dǎo)的耐藥51
第六節(jié)結(jié)語56
參考文獻56

第七章外排泵介導(dǎo)的細(xì)菌耐藥 60
第一節(jié)細(xì)菌外排泵的種類和基本結(jié)構(gòu)特征63
第二節(jié)外排泵的外排機制72
第三節(jié)臨床上一些重要病原菌的代表性外排泵74
第四節(jié)外排系統(tǒng)與抗菌藥物耐藥78
第五節(jié)外排機制與其他耐藥機制復(fù)合存在81
第六節(jié)結(jié)語82
參考文獻83

第八章β-內(nèi)酰胺酶介導(dǎo)細(xì)菌耐藥的進化軌跡 86
第一節(jié)青霉素酶引發(fā)了全球第一次耐藥危機86
第二節(jié)廣譜酶的出現(xiàn)奏響了β-內(nèi)酰胺酶廣泛進化的序曲87
第三節(jié)超廣譜酶的出現(xiàn)是細(xì)菌耐藥進化的一個重要分水嶺87
第四節(jié)抑制劑耐藥β-內(nèi)酰胺酶展現(xiàn)細(xì)菌耐藥進化的無所不能88
第五節(jié)“沉默的”AmpC β-內(nèi)酰胺酶基因已被喚醒88
第六節(jié)碳青霉烯酶是細(xì)菌對抗β-內(nèi)酰胺類抗生素的殺手锏89
第七節(jié)β-內(nèi)酰胺酶進化的總體趨勢89
參考文獻91

第二篇細(xì)菌耐藥遺傳學(xué)基礎(chǔ) 93
第九章耐藥基因 94
第一節(jié)耐藥基因在細(xì)菌耐藥中的核心地位95
第二節(jié)耐藥基因的起源97
第三節(jié)水平基因轉(zhuǎn)移104
第四節(jié)耐藥基因向病原菌的轉(zhuǎn)移和進一步散播111
第五節(jié)結(jié)語114
參考文獻117

第十章質(zhì)粒 119
第一節(jié)質(zhì)粒的基本屬性120
第二節(jié)質(zhì)粒的分類121
第三節(jié)質(zhì)粒的模塊化結(jié)構(gòu)122
第四節(jié)質(zhì)粒與細(xì)菌耐藥125
第五節(jié)結(jié)語134
參考文獻135

第十一章轉(zhuǎn)座子 137
第一節(jié)轉(zhuǎn)座子的分類138
第二節(jié)轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)特征139
第三節(jié)轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座機制144
第四節(jié)轉(zhuǎn)座子與細(xì)菌耐藥146
第五節(jié)結(jié)語148
參考文獻148

第十二章插入序列 150
第一節(jié)插入序列的分類和分布151
第二節(jié)插入序列的結(jié)構(gòu)特征152
第三節(jié)插入序列的轉(zhuǎn)座機制152
第四節(jié)插入序列的功能作用154
第五節(jié)插入序列與細(xì)菌耐藥155
第六節(jié)結(jié)語161
參考文獻161

第十三章整合子 163
第一節(jié)整合子的定義164
第二節(jié)整合子的結(jié)構(gòu)165
第三節(jié)整合子的分類和細(xì)菌分布168
第四節(jié)基因盒及其結(jié)構(gòu)170
第五節(jié)基因盒的插入和切除172
第六節(jié)基因盒基因的表達173
第七節(jié)整合子的整合機制175
第八節(jié)整合子的起源和進化177
第九節(jié)整合子與細(xì)菌耐藥179
第十節(jié)結(jié)語180
參考文獻180

第十四章插入序列共同區(qū) 182
第一節(jié)ISCR的起源185
第二節(jié)ISCR的轉(zhuǎn)座機制187
第三節(jié)ISCR與細(xì)菌耐藥188
第四節(jié)結(jié)語191
參考文獻191

第三篇β-內(nèi)酰胺酶 193
第十五章β-內(nèi)酰胺酶的命名 194
第一節(jié)β-內(nèi)酰胺酶命名的歷史和現(xiàn)狀194
第二節(jié)歷史性的一酶多名現(xiàn)象199
第三節(jié)β-內(nèi)酰胺酶命名中的爭議200
第四節(jié)現(xiàn)有β-內(nèi)酰胺酶命名法的不足200
參考文獻201

第十六章β-內(nèi)酰胺酶的分類 202
第一節(jié)β-內(nèi)酰胺酶分類的“歷史”202
第二節(jié)Ambler分子學(xué)分類體系203
第三節(jié)Bush-Jacoby-Medeiros功能性分類體系205
第四節(jié)ESBL術(shù)語學(xué)中的一些爭鳴211
第五節(jié)新酶的鑒定程序213
第六節(jié)結(jié)語214
參考文獻214

第十七章青霉素酶 216
第一節(jié)青霉素酶的組成216
第二節(jié)A類β-內(nèi)酰胺酶的生化特性223
第三節(jié)A類β-內(nèi)酰胺酶的催化機制225
第四節(jié)D類β-內(nèi)酰胺酶概述228
第五節(jié)D類β-內(nèi)酰胺酶的生化特性231
第六節(jié)D類β-內(nèi)酰胺酶催化機制233
第七節(jié)結(jié)語234
參考文獻234

第十八章超廣譜β-內(nèi)酰胺酶概述 236
第一節(jié)ESBL出現(xiàn)在抗生素年代236
第二節(jié)ESBL家族的起源之謎237
第三節(jié)ESBL家族及其成員全球分布不均一237
第四節(jié)產(chǎn)ESBL細(xì)菌的復(fù)合耐藥238
第五節(jié)ESBL的發(fā)展和進化趨勢239
參考文獻239

第十九章TEM型ESBL 240
第一節(jié)TEM型ESBL的出現(xiàn)240
第二節(jié)TEM型酶的分子內(nèi)突變產(chǎn)生多樣化ESBL241
第三節(jié)TEM型ESBL的水解特性246
第四節(jié)TEM/SHV型ESBL的全球流行249
第五節(jié)TEM型ESBL的遺傳支持252
第六節(jié)結(jié)語252
參考文獻252

第二十章SHV型ESBL 254
第一節(jié)SHV型ESBL的出現(xiàn)254
第二節(jié)SHV型酶分子內(nèi)突變產(chǎn)生多樣化的ESBL255
第三節(jié)SHV型ESBL的水解特性257
第四節(jié)SHV型ESBL的底物輪廓和流行病學(xué)特征258
第五節(jié)SHV型ESBL的遺傳學(xué)支持259
第六節(jié)結(jié)語259
參考文獻260

第二十一章CTX-M型ESBL 261
第一節(jié)CTX-M型ESBL的出現(xiàn)261
第二節(jié)CTX-M型ESBL的分類263
第三節(jié)CTX-M型ESBL的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系267
第四節(jié)CTX-M型ESBL的生化特征269
第五節(jié)產(chǎn)CTX-M型ESBL的細(xì)菌分布271
第六節(jié)突變所致CTX-M型ESBL的進化272
第七節(jié)blaCTX-M基因的起源278
第八節(jié)CTX-M型ESBL的動員（帶動轉(zhuǎn)移）282
第九節(jié)CTX-M型ESBL的流行病學(xué)291
第十節(jié)產(chǎn)CTX-M型ESBL病原菌的社區(qū)散播298
第十一節(jié)結(jié)語302
參考文獻303

第二十二章較次要的ESBL家族 307
第一節(jié)OXA型ESBL309
第二節(jié)PER型ESBL314
第三節(jié)VEB型ESBL319
第四節(jié)GES型ESBL322
第五節(jié)其他更少見的ESBL家族326
第六節(jié)結(jié)語328
參考文獻328

第二十三章AmpC β-內(nèi)酰胺酶概述 333
參考文獻335

第二十四章染色體編碼的AmpC β-內(nèi)酰胺酶 336
第一節(jié)染色體AmpC β-內(nèi)酰胺酶的起源和細(xì)菌分布336
第二節(jié)AmpC β-內(nèi)酰胺酶的結(jié)構(gòu)和生化特性338
第三節(jié)AmpC β-內(nèi)酰胺酶的水解特征339
第四節(jié)AmpC β-內(nèi)酰胺酶的動力學(xué)參數(shù)340
第五節(jié)AmpC β-內(nèi)酰胺酶產(chǎn)生的調(diào)節(jié)342
第六節(jié)染色體編碼的AmpC β-內(nèi)酰胺酶的流行病學(xué)351
第七節(jié)結(jié)語352
參考文獻353

第二十五章質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶 356
第一節(jié)概述356
第二節(jié)各種質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶家族的發(fā)現(xiàn)356
第三節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶的種系發(fā)生和分簇361
第四節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)AmpC β-內(nèi)酰胺酶的基本生化特性363
第五節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶的遺傳學(xué)支持364
第六節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)的AmpC β-內(nèi)酰胺酶的流行病學(xué)366
第七節(jié)結(jié)語370
參考文獻370

第二十六章超廣譜AmpC β-內(nèi)酰胺酶 374
第一節(jié)概述374
第二節(jié)超廣譜AmpC β-內(nèi)酰胺酶的出現(xiàn)375
第三節(jié)超廣譜AmpC β-內(nèi)酰胺酶的結(jié)構(gòu)-功能關(guān)系376
第四節(jié)超廣譜AmpC β-內(nèi)酰胺酶的生化特性381
第五節(jié)超廣譜AmpC β-內(nèi)酰胺酶的流行病學(xué)382
第六節(jié)結(jié)語384
參考文獻384

第二十七章碳青霉烯酶概述 386
第一節(jié)碳青霉烯酶的多樣性386
第二節(jié)碳青霉烯酶的起源和散播387
第三節(jié)產(chǎn)碳青霉烯酶細(xì)菌的復(fù)合耐藥和治療困境387
第四節(jié)碳青霉烯酶的進化趨勢388
參考文獻388

第二十八章A類碳青霉烯酶 390
第一節(jié)概述390
第二節(jié)染色體A類碳青霉烯酶391
第三節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)的GES型碳青霉烯酶398
第四節(jié)質(zhì)粒介導(dǎo)的KPC型碳青霉烯酶400
第五節(jié)結(jié)語416
參考文獻416

第二十九章D類碳青霉烯酶 421
第一節(jié)概述421
第二節(jié)D類碳青霉烯酶的出現(xiàn)和分類424
第三節(jié)D類碳青霉烯酶的底物特征434
第四節(jié)D類碳青霉烯酶的結(jié)構(gòu)特征和水解機制435
第五節(jié)D類碳青霉烯酶的遺傳學(xué)支持437
第六節(jié)D類碳青霉烯酶的流行病學(xué)440
第七節(jié)結(jié)語444
參考文獻444

第三十章B類碳青霉烯酶 448
第一節(jié)概述448
第二節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶的出現(xiàn)和進化449
第三節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶的分類和分組456
第四節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶的一般性結(jié)構(gòu)特征459
第五節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶的水解機制461
第六節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶抑制劑465
第七節(jié)IMP家族465
第八節(jié)VIM家族473
第九節(jié)NDM家族482
第十節(jié)其他較次要的金屬β-內(nèi)酰胺酶家族487
第十一節(jié)金屬β-內(nèi)酰胺酶的流行病學(xué)488
第十二節(jié)產(chǎn)金屬β-內(nèi)酰胺酶細(xì)菌所致感染的治療497
第十三節(jié)結(jié)語501
參考文獻502

第三十一章β-內(nèi)酰胺酶抑制劑及其復(fù)方制劑 505
第一節(jié)概述505
第二節(jié)β-內(nèi)酰胺酶抑制劑507
參考文獻516

第三十二章針對傳統(tǒng)β-內(nèi)酰胺酶抑制劑耐藥的β-內(nèi)酰胺酶 518
第一節(jié)概述518
第二節(jié)IRT的出現(xiàn)519
第三節(jié)IRS的出現(xiàn)522
第四節(jié)CMT的出現(xiàn)523
第五節(jié)造成IRT表型的各種氨基酸置換524
第六節(jié)IRT的動力學(xué)特性525
第七節(jié)IRT的流行病學(xué)527
第八節(jié)結(jié)語527
參考文獻527

第四篇全球細(xì)菌耐藥的現(xiàn)況、發(fā)展趨勢和應(yīng)對措施 531
第三十三章全球細(xì)菌耐藥現(xiàn)況和發(fā)展趨勢 532
第一節(jié)各種“超級細(xì)菌”紛紛涌現(xiàn)532
第二節(jié)多藥耐藥已經(jīng)成為“新常態(tài)”533
第三節(jié)全球化背景下的耐藥細(xì)菌散播——如虎添翼534
第四節(jié)抗菌藥物應(yīng)用和細(xì)菌耐藥發(fā)展趨勢的關(guān)聯(lián)性535
參考文獻537

第三十四章細(xì)菌耐藥的全球應(yīng)對 540
第一節(jié)合理應(yīng)用抗菌藥物——知易行難540
第二節(jié)全新抗菌藥物產(chǎn)品供應(yīng)線面臨斷流的風(fēng)險542
第三節(jié)遏制抗菌藥物在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用勢在必行543
參考文獻546

附錄氨基酸簡寫符號 548