化學信息學

第1章　化學信息學導論 1
1.1　分子結構與性質的數(shù)值化表述及數(shù)據(jù)收集 1
1.2　圖論與概率論在分子結構信息中的應用 4
1.3　數(shù)學建模與信息轉化 7
1.3.1　甄選輸入變量 7
1.3.2　數(shù)據(jù)收集 8
1.3.3　數(shù)值模型的參數(shù)訓練與測試 8
1.4　受體-配體打分函數(shù)模型——從經(jīng)驗化模型到人工神經(jīng)網(wǎng)絡 9
1.4.1　主成分分析 10
1.4.2　人工神經(jīng)網(wǎng)絡 10

第2章　文獻檢索概論 13
2.1 信息、知識、情報和文獻 13
2.2　科技文獻的級別 14
2.3　科技文獻類型 15
2.4　科技文獻的出版形式及科技文獻的特點 17
2.4.1　科技文獻的出版形式 17
2.4.2　科技文獻的特點 17
2.5　科技文獻檢索概述 18
2.5.1　科技文獻檢索的含義 18
2.5.2　文獻的存儲與檢索 18
2.5.3　科技文獻檢索的意義與作用 19
2.5.4　科技文獻檢索工具 19
2.6　科技文獻檢索的途徑 20
2.6.1　根據(jù)文獻的外部特征進行檢索 20
2.6.2　根據(jù)文獻的內容特征進行檢索 21
2.7　科技文獻的檢索方法 21
2.7.1　常規(guī)法 21
2.7.2　追溯法 22
2.7.3　循環(huán)法（綜合法） 22
2.7.4　基本檢索步驟 23

第3章　化學數(shù)據(jù)庫 24
3.1　全文文獻數(shù)據(jù)庫 25
3.1.1　全文數(shù)據(jù)庫簡介 25
3.1.2　重要中文全文數(shù)據(jù)庫 25
3.1.3　重要英文全文數(shù)據(jù)庫 28
3.2　文摘索引數(shù)據(jù)庫 32
3.2.1　文摘索引數(shù)據(jù)庫簡介 32
3.2.2　文摘索引數(shù)據(jù)庫發(fā)展趨勢及意義 33
3.2.3　重要外文文摘索引數(shù)據(jù)庫 33
3.2.4　Web of Science（SCI）數(shù)據(jù)庫的介紹與使用 35
3.2.5　SciFinder（CAS）數(shù)據(jù)庫的介紹與使用 36
3.2.6　X-MOL知識平臺 41
3.3　特種文獻數(shù)據(jù)庫 54
3.3.1　專利文獻資源與檢索 54
3.3.2　學位論文資源與檢索 55
3.3.3　化學事實數(shù)據(jù)庫 55

第4章　化學軟件簡介與ChemBioOffice使用 57
4.1　化學軟件概述 57
4.2　化學結構可視化軟件 58
4.2.1　二維化學結構式繪制軟件 58
4.2.2　化學三維結構繪制軟件 59
4.3　數(shù)據(jù)處理軟件 59
4.4　文獻管理軟件 60
4.5　圖譜解析軟件 61
4.6　化學計算軟件 61
4.7　其他軟件 62
4.8　ChemBioOffice軟件 62
4.8.1　ChemDraw的使用方法 62
4.8.2　ChemDraw的其他功能 68
4.8.3　分子模型軟件Chem3D 70

第5章　科學數(shù)據(jù)處理軟件 80
5.1　數(shù)據(jù)分析軟件Origin概述 80
5.2　Origin界面簡介 81
5.2.1　Origin常用術語 81
5.2.2　Origin菜單介紹 82
5.3　Origin的基本使用 83
5.3.1　數(shù)據(jù)導入 83
5.3.2　數(shù)據(jù)作圖 85
5.3.3　繪制工作曲線 88
5.3.4　區(qū)域性擬合 90
5.3.5　非線性擬合 92
5.3.6　疊圖與多Y軸圖的繪制 95
5.3.7　多屏圖的繪制 97

第6章　圖片處理軟件Photoshop 100
6.1　科技作圖 100
6.1.1　科技論文中的圖片 100
6.1.2　科技論文圖表規(guī)范 101
6.2　繪圖基本概念 102
6.3　Photoshop簡介 105
6.3.1　Photoshop界面簡介 105
6.3.2　Photoshop基本概念 107
6.3.3　Photoshop常用功能 108
6.3.4　細胞膜模型的繪制 111
6.3.5　組圖的繪制 113
6.3.6　透視色譜圖 115
6.3.7　電鏡圖上色 118

第7章　Adobe Illustrator科研繪圖 121
7.1　Illustrator界面介紹 121
7.1.1　菜單欄 122
7.1.2　工具箱 122
7.1.3　工具屬性欄 123
7.1.4　面板 123
7.2　Illustrator基本概念和常用功能 123
7.2.1　路徑和錨點 123
7.2.2　圖層 125
7.2.3　畫筆 126
7.2.4　符號 126
7.3　Illustrator 基礎操作 126
7.3.1　填色和描邊 126
7.3.2　對象的基本操作方法 129
7.3.3　路徑查找器 129
7.3.4　形狀生成器和實時上色工具 131
7.3.5　混合工具 133
7.3.6　效果濾鏡 134
7.4　Illustrator實例繪制 134
7.4.1　實例1——模式圖 134
7.4.2　實例2——小腸絨毛細胞 145

第8章　核磁共振譜圖解析軟件ACD/NMR與文獻管理軟件EndNote 156
8.1　ACD/NMR軟件介紹 156
8.1.1　ACD/NMR Processor的主要功能 157
8.1.2　ACD/NMR Processor的使用簡介 157
8.2　文獻的引用 163
8.2.1　文獻的規(guī)范化引用 163
8.2.2　引用文獻的意義 164
8.2.3　引用文獻注意事項 165
8.3　文獻管理工具EndNote 165
8.3.1　EndNote簡介 165
8.3.2　EndNote的文獻導入與檢索 167
8.3.3　使用EndNote插入?yún)⒖嘉墨I 168

第9章　學位論文排版 171
9.1　文檔的新建與保存 172
9.2　頁面設置 173
9.2.1　頁面布局設置 174
9.2.2　目錄的生成 177
9.2.3　分節(jié)符 178
9.2.4　頁眉、頁腳、頁碼的設置 179
9.3　樣式的使用 182
9.3.1　樣式的創(chuàng)建 182
9.3.2　章節(jié)標題的設置與多級列表的使用 184
9.3.3　更新目錄 194
9.3.4　圖表的題注和交叉引用 196
9.3.5　公式的題注和交叉引用 200
9.4　參考文獻 204
9.4.1　著錄項目和著錄格式 204
9.4.2　利用EndNote插入?yún)⒖嘉墨I 205
9.5　常用的小技巧匯總 205
9.5.1　快速定位導航窗格 205
9.5.2　三線表的畫法 206
9.5.3　快捷鍵 208

參考文獻 210