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內(nèi)容簡(jiǎn)介

　　來(lái)自英國(guó)劍橋大學(xué)的三位作者引用了大量的研究文獻(xiàn)，闡述了生物芯片技術(shù)的最新進(jìn)展，比較全面地覆蓋了生物芯片的各個(gè)領(lǐng)域，使這項(xiàng)前沿技術(shù)不再神秘?！渡镄酒夹g(shù)與實(shí)踐》概括總結(jié)了生物芯片的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)、設(shè)計(jì)和制備、用于生物芯片實(shí)驗(yàn)的樣本采集和標(biāo)記、生物芯片雜交等最新實(shí)驗(yàn)方法。詳細(xì)討論了生物芯片實(shí)驗(yàn)技術(shù)所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)的分析方法，以及利用生物芯片所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析、聚類和分類的科學(xué)方法。對(duì)使用比較廣泛的幾種生物芯片，如基因組生物芯片、外顯子生物芯片、疊瓦生物芯片等，進(jìn)行了有關(guān)探針設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)方法的詳細(xì)介紹。以生物芯片在醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用為重點(diǎn)，論述了不同種類的生物芯片在疾病研究、基因分型、藥物開發(fā)等領(lǐng)域的應(yīng)用。介紹了蛋白質(zhì)芯片、細(xì)胞芯片和組織芯片等多種新型生物芯片的制備和應(yīng)用?！渡镄酒夹g(shù)與實(shí)踐》適用于生物芯片研發(fā)應(yīng)用以及分子生物學(xué)、生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)、生物信息學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、生物技術(shù)、食品安全檢測(cè)等生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)生、教學(xué)科研人員參考使用，也可供生物技術(shù)企業(yè)的研發(fā)者和決策者參考使用。

作者簡(jiǎn)介

暫缺《生物芯片技術(shù)與實(shí)踐》作者簡(jiǎn)介

圖書目錄

譯者序
前言和致謝
第一章引言
1.1 技術(shù)介紹
1.2 發(fā)展概況
1.3 簡(jiǎn)要概述
參考文獻(xiàn)
第二章實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)基礎(chǔ)
2.1 生物芯片基因表達(dá)測(cè)量中的變異來(lái)源
2.2 對(duì)照和重復(fù)
2.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.4 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第三章生物芯片的設(shè)計(jì)和制備
3.1 探針的選擇
3.2 cDNA和擴(kuò)增產(chǎn)物探針
3.3 寡核苷酸探針
3.4 生物芯片的制備
3.5 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第四章樣本收集和標(biāo)記
4.1 樣本收集和RNA提取
4.2 RNA的質(zhì)量評(píng)價(jià)
4.3 cDNA的合成
4.4 標(biāo)記方法
4.5 信號(hào)放大
4.6 RNA擴(kuò)增
4.7 擴(kuò)增方法的比較
4.8 熒光標(biāo)記樣本的質(zhì)量控制
4.9 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第五章雜交和掃描
5.1 雜交
5.2 數(shù)據(jù)獲取
5.3 信號(hào)點(diǎn)定位
5.4 方法比較
5.5 數(shù)據(jù)提取
5.6 質(zhì)量控制基本要求
5.7 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第六章數(shù)據(jù)預(yù)處理
6.1 預(yù)處理基本原理
6.2 系統(tǒng)誤差的來(lái)源
6.3 背景校正
6.4 數(shù)據(jù)過(guò)濾、標(biāo)記和加權(quán)
6.5 缺失值的處理
6.6 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換
6.7 空間效應(yīng)的處理
6.8 Print-Tip Group Loess歸一化
6.9 二維(2D)Loess
6.10 復(fù)合Loess歸一化
6.11 加權(quán)Loess歸一化
6.12 使用重復(fù)探針增強(qiáng)歸一化效果
6.13 “片間”歸一化
6.14 關(guān)于質(zhì)控的其他注意事項(xiàng)
6.15 生物芯片質(zhì)量控制協(xié)會(huì)(MAQC)
6.16 外源RNA對(duì)照協(xié)會(huì)(ERCC)
6.17 EMERALD協(xié)會(huì)
6.18 Affymetrix GeneChip數(shù)據(jù)的預(yù)處理
6.19 探針校正和整合
6.20 背景校正
6.21 歸一化
6.22 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第七章差異表達(dá)
7.1 引言
7.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)推斷
7.3 參數(shù)統(tǒng)計(jì)
7.4 生物芯片數(shù)據(jù)的線性模型(LIMMA)
7.5 非參數(shù)統(tǒng)計(jì)
7.6 基因-類別檢驗(yàn)
7.7 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第八章聚類和分類
8.1 引言
8.2 相似性度量
8.3 無(wú)監(jiān)督分析方法：聚類和分區(qū)
8.4 評(píng)價(jià)聚類質(zhì)量
8.5 維數(shù)減少
8.6 有監(jiān)督的方法
8.7 模型質(zhì)量評(píng)價(jià)
8.8 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第九章生物芯片數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)倉(cāng)
9.1 引言
9.2 ArrayExpress數(shù)據(jù)庫(kù)
9.3 Gene Expression Omnibus(GEO)
9.4 其他數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)倉(cāng)
9.5 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第十章基因組芯片分析
10.1 基因組芯片
10.2 外顯子芯片
10.3 疊瓦芯片
10.4 擴(kuò)增子及BAC芯片
10.5 寡核苷酸疊瓦芯片
10.6 疊瓦芯片的應(yīng)用
10.7 疊瓦芯片的分析
10.8 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第十一章生物芯片技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
11.1 引言
11.2 病原體研究：瘧疾
11.3 人類疾病表達(dá)譜研究
11.4 比較基因組雜交芯片
11.5 SNPS和基因分型
11.6 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第十二章其他種類的生物芯片技術(shù)
12.1 蛋白質(zhì)結(jié)合芯片
12.2 細(xì)胞和組織芯片
12.3 蛋白質(zhì)芯片
12.4 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第十三章生物芯片的未來(lái)與展望
13.1 生物芯片技術(shù)
13.2 標(biāo)記和檢測(cè)技術(shù)
13.3 成像技術(shù)
13.4 分析技術(shù)
參考文獻(xiàn)
索引