Photoshop科學圖像處理：方法、測量與輸出

第I部分學術規(guī)范與背景知識
第1章 可視化數(shù)據(jù)及其學術規(guī)范
1.1 可視化數(shù)據(jù)的精確表示
1.1.1 誤表示發(fā)生的時機
1.1.2 圖像的種類
1.1.3 創(chuàng)作者須知
1.1.4 使用標準與參考值
第2章 圖像通用規(guī)則
2.1 規(guī)則
2.2 圖像獲取階段
2.2.1 準備樣本
2.2.2 優(yōu)化成像系統(tǒng)
2.2.3 關閉自動過濾功能
2.2.4 位深度
2.2.5 裁切
2.2.6 明場圖像白平衡的顏色
2.2.7 噪聲圖像與幀平均
2.2.8 存檔
2.2.9 操作規(guī)程
2.3 后期處理階段
2.3.1 全局修正及應用
2.3.2 裁切與修齊
2.3.3 顏色模式變換
2.3.4 改變位深度
2.3.5 顏色校正
2.3.6 數(shù)碼相機中的彩色噪聲
2.3.7 合并及圖像棧功能
2.3.8 標志.文字.標尺
2.4 適應輸出階段
2.4.1 減少位深度
2.4.2 白色(或黑色)極限
2.4.3 調(diào)整圖像大小
2.4.4 顏色模式的變換：從RGB到CMYK
2.4.5 文件格式
2.4.6 說明文檔
2.5 后期處理中禁止的操作
2.5.1 污點修正
2.5.2 從一幅圖像向另一幅圖像移取特征
2.5.3 有目的地操作可視化數(shù)據(jù)
2.5.4 改變圖像大小(子采樣)
2.5.5 使用亮度／對比度工具
2.5.6 復制／粘貼操作
第3章 特定圖像類型的規(guī)則
3.1 測量OD／I的圖像
3.1.1 平板掃描儀上的電泳樣本
3.1.2 圖像獲取
3.1.3 后期處理
3.1.4 使用照相機／掃描光束系統(tǒng)獲取測量OD／I的圖像
3.1.5 圖像獲取
3.1.6 后期處理
3.2 表示性圖像
3.2.1 圖像獲取
3.2.2 后期處理
3.2.3 適應輸出
3.3 用于量化和可視化的圖像
3.3.1 可視化
3.3.2 圖像獲取
3.3.3 后期處理
第II部分輸入.校正與輸出
第4章 獲取最佳輸入
4.1 用標準(復式)顯微鏡獲取圖像
4.1.1 精確表示
4.1.2 均勻照明
4.1.3 減少噪聲
4.1.4 顯微鏡設置
4.1.5 在相機或獲取軟件中獲取圖像
4.2 激光共聚焦掃描系統(tǒng)
4.2.1 按照用途分類的共焦成像
4.2.2 共焦系統(tǒng)的成像步驟
4.3 平板掃描儀
4.3.1 平板掃描儀的預掃描設置
4.3.2 通用的掃描過程
4.3.3 關于掃描的幾點提示
4.4 立體顯微鏡成像
4.4.1 控制眩光與照明
4.4.2 關于復雜樣本成像的幾點提示
4.5 環(huán)境成像
4.5.1 曝光時間與光圈
4.5.2 照明
4.5.3 校準相機
4.6 PowerPoint及其他程序中的圖像
4.6.1 將復制粘貼作為(低劣的)解決方法
4.6.2 保持分辨率不變的最佳方法
第5章 Photoshop設置與標準過程
5.1 顏色和對比度匹配的方法
5.2 顏色設置
5.2.1 非同步
5.2.2 工作空間
5.2.3 顏色管理方案
5.2.4 轉換選項
5.3 標準過程
5.3.1 輸出色階和ColorSampler工具
5.3.2 尋找黑色和白色參考點
5.3.3 設置白色和黑色輸出色階
第6章 打開圖像與初始化步驟
6.1 圖像校正流程表
6.2 打開圖像
6.2.1 Bridge數(shù)據(jù)庫程序(適用于CS2和CS3)
6.2.2 SmartObject或復制圖像
6.2.3 打開時存在問題的文件
6.2.4 在AdobeCameraRaw中打開圖像
6.2.5 打開多幅圖像，合并為一幅圖像
6.2.6 用于合成或分層的圖像棧
6.2.7 打開多幅圖像進行照片合并(照片縫合)
6.3 預校準修正
6.3.1 IndexedColor(轉換為RGBColor)
6.3.2 校正不均勻照明
6.3.3 問題圖像
6.3.4 減少噪聲
第7章 顏色校正與最終步驟
7.1 明場顏色校正與RGB顏色轉換為CMYK
7.1.1 精確的顏色校正
7.1.2 參考區(qū)域
7.1.3 色調(diào)與飽和度
7.1.4 彩色噪聲
7.1.5 白色或灰色吸管方法
7.1.6 與參考圖像的顏色匹配
7.1.7 其他手動或自動顏色校正方法
7.1.8 降低飽和度.修正色調(diào)，使圖像符合CMYK標準
7.1.9 彩色邊緣現(xiàn)象與彩色噪聲的消除
7.2 明場圖像彩色模式到灰度模式的變換
7.3 單色暗場圖像
7.3.1 設置黑白極限與亮度匹配
7.3.2 單色圖像轉換為灰度圖像
7.3.3 彩色化灰度圖像
7.3.4 修正現(xiàn)有的顏色
7.3.5 顯示共區(qū)域化／共存
7.3.6 使圖像符合CMYK標準
7.3.7 彩色化.脫色動作
7.4 利用偽彩色和彩色化將灰度圖像轉換為彩色圖像
7.4.1 根據(jù)顏色表偽彩色化圖像
7.4.2 色調(diào)分離
7.5 灰度圖像的調(diào)色
7.6 銳化
7.6.1 UnsharpMask銳化方法
7.6.2 HighPass銳化方法
7.7 Gamma
第8章 制作插圖／圖解與適應輸出
8.1 制作插圖或圖解
8.1.1 自動的保留分辨率法
8.1.2 手動的保留分辨率法
8.1.3 自動的出版分辨率法
8.1.4 手動的出版分辨率法
8.1.5 匹配圖像背景
8.1.6 為插圖添加文字
8.1.7 對齊文本.編號及符號
8.1.8 將文本和直線圖層合并為單個圖層
8.1.9 符號.形狀及箭頭
8.2 編輯圖表
8.3 圖像中的局部圖
8.4 針對輸出的重采樣(ImageSize)
8.5 銳化.Gamma.CMYKColor及保存插圖
8.6 輸出
8.6.1 噴墨打印
8.6.2 激光打印
8.6.3 電子文檔
第III部分分割與量化
第9章 從背景中提取相關特征
9.1 使用Photoshop還是體視學宋分割圖像
9.1.1 體視學
9.1.2 計算機輔助圖像測量
9.1.3 混用兩種方法
9.1.4 手動測量
9.2 計算機輔助測量中分割圖像的過程
9.2.1 針對需要的校正檢查圖像
9.2.2 特征聚集或求平均特征
9.2.3 彩色圖像：尋找對比度最高的灰度通道或者根據(jù)顏色選擇
9.2.4 識別特征與背景的邊界
9.2.5 應用HighPass濾鏡
9.2.6 使用Threshold進行二值化
9.2.7 修改二值化的圖像
9.2.8 參考區(qū)域
9.2.9 使用相關圖像測試分割過程
9.2.1 0直方圖和線性直方圖匹配
9.2.1 1創(chuàng)建動作(或腳本)將所有步驟自動化
9.3 手動分割
9.3.1 使用網(wǎng)格分割圖像
9.3.2 創(chuàng)建小的.固定的選區(qū)
9.3.3 使用Lasso或MagicWand工具手動選擇
第10章 測量圖像
10.1 測量所選擇的特征
10.2 在舊的Photoshop版本中獲取測量值
10.3 在Photoshop中測量共區(qū)域化／共存
10.4 使用數(shù)據(jù)庫／電子表格程序來區(qū)分特征
參考文獻