免疫信息學(xué)原理及其應(yīng)用

第1章　緒論
　1.1　免疫信息學(xué)是一門新興交叉學(xué)科
　1.2　免疫信息學(xué)研究的基本問題
　1.3　免疫信息學(xué)研究的基本方法
1.3.1 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建方法
1.3.2　計(jì)算與統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
1.3.3　數(shù)學(xué)建模與計(jì)算機(jī)模擬方法
　1.4　免疫信息學(xué)的應(yīng)用
1.4.1 系統(tǒng)免疫學(xué)理論與人工智能研究
1.4.2　疫苗研發(fā)與傳染病研究
1.4.3 實(shí)驗(yàn)與臨床免疫學(xué)研究
　參考文獻(xiàn)
第2章　免疫生物學(xué)基礎(chǔ)
　2.1　免疫應(yīng)答
2.1.1 天然免疫
2.1.2　適應(yīng)性免疫
　2.2　免疫系統(tǒng)的組成與結(jié)構(gòu)
2.2.1 免疫器官
2.2.2 免疫細(xì)胞
2.2.3 免疫分子
　2.3　免疫系統(tǒng)的機(jī)制
2.3.1 抗原
2.3.2 免疫系統(tǒng)的特異性識(shí)別
2.3.3 免疫記憶與免疫耐受
　2.4　免疫監(jiān)督
　2.5　免疫效應(yīng)及其調(diào)節(jié)機(jī)制
2.5.1 免疫效應(yīng)
2.5.2 免疫調(diào)節(jié)
　2.6　免疫系統(tǒng)的復(fù)雜性特征
2.6.1 復(fù)雜性適應(yīng)系統(tǒng)
2.6.2 免疫系統(tǒng)的自組織
2.6.3 免疫系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)
　2.7　小結(jié)
　參考文獻(xiàn)
第3章　免疫系統(tǒng)功能模建
　3.1　淋巴細(xì)胞的免疫識(shí)別與增殖動(dòng)力學(xué)
3.1.1 T、B淋巴細(xì)胞受體庫大小估計(jì)
3.1.2　淋巴細(xì)胞增殖與分化的克隆模型
　3.2　獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫應(yīng)答
3.2.1 獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫記憶
3.2.2　獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫耐受
　3.3　免疫系統(tǒng)的調(diào)節(jié)
3.3.1 免疫相關(guān)細(xì)胞的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
3.3.2 免疫應(yīng)答的細(xì)胞調(diào)節(jié)
3.3.3 宿主免疫應(yīng)答的系統(tǒng)水平的調(diào)節(jié)
　3.4　小結(jié)
　參考文獻(xiàn)
第4章　免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)挖掘
　4.1　數(shù)據(jù)庫概念
　4.2　免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
4.2.1 簡介
4.2.2　基于網(wǎng)絡(luò)的免疫信息學(xué)公共數(shù)據(jù)庫利用
4.2.3　免疫多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(IPD)
4.2.4 SYFPEITHI
4.2.5 IMTECH免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
4.2.6 抗原決定簇?cái)?shù)據(jù)庫(IEDB)
　4.3　數(shù)據(jù)挖掘與知識(shí)發(fā)現(xiàn)
4.3.1 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學(xué)中的作用
4.3.2 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學(xué)中的應(yīng)用步驟
4.3.3 短肽預(yù)測的數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵗?br />　參考文獻(xiàn)
第5章　B細(xì)胞表位的預(yù)測
第6章　T細(xì)胞表位的預(yù)測
第7章　抗原處理與TAP轉(zhuǎn)運(yùn)預(yù)測
第8章　感染性疾病的傳播動(dòng)力學(xué)及免疫流行病學(xué)模型　
第9章　抗病毒疫苗研究
第10章　反向疫苗學(xué)在抗細(xì)菌疫苗中的應(yīng)用
第11章　免疫信息學(xué)在抗原蟲病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用
第12章　抗蠕蟲疫苗研發(fā)
第13章　免疫信息學(xué)和抗腫瘤疫苗的研發(fā)
第14章　生物信息學(xué)在抗自身免疫病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用
第15章　免疫信息學(xué)在實(shí)驗(yàn)與臨床免疫學(xué)中的應(yīng)用
附錄A
附錄B