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內(nèi)容簡介

　　《生物大分子的數(shù)學(xué)描述及其應(yīng)用》是在編者實(shí)際從事的課題基礎(chǔ)上形成的，從這個意義上講，《生物大分子的數(shù)學(xué)描述及其應(yīng)用》可以說是一份工作匯報。建立生物學(xué)數(shù)據(jù)以及各種數(shù)據(jù)間復(fù)雜關(guān)系的數(shù)學(xué)模型，然后在此基礎(chǔ)上分析和解釋相應(yīng)生物學(xué)意義，進(jìn)而探索其固有的生物學(xué)規(guī)律并研究相關(guān)生物信息學(xué)問題，這是《生物大分子的數(shù)學(xué)描述及其應(yīng)用》的特色之處?！渡锎蠓肿拥臄?shù)學(xué)描述及其應(yīng)用》主要內(nèi)容包括生物大分子的圖形表示；生物序列的數(shù)值刻畫；序列與結(jié)構(gòu)的粗粒化描述；蛋白質(zhì)編碼基因識別等。

作者簡介

　　李春，渤海大學(xué)數(shù)學(xué)系副教授。2006年畢業(yè)于大連理工大學(xué)應(yīng)用數(shù)學(xué)系計算數(shù)學(xué)專業(yè)，獲理學(xué)博士學(xué)位。現(xiàn)為遼寧省第四批“百千萬人才工程”千人層次人選，應(yīng)用數(shù)學(xué)遼寧省重點(diǎn)掌科帶頭人，遼寧省普通高等學(xué)校優(yōu)秀青年骨干教師，錦州市酋批市級后備學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人。渤海大學(xué)學(xué)術(shù)帶頭人。近年來主要從事組合數(shù)掌和生物信息學(xué)的教學(xué)和科研工作。主持和參與完成國r永自然科學(xué)基金項目和遼寧省教育廳項目五項。已出版教材一部，發(fā)表論文三十余篇。錢偉懿，渤海大學(xué)數(shù)學(xué)系教授。2004年畢業(yè)于大連理工大掌應(yīng)用數(shù)學(xué)系運(yùn)籌學(xué)與控制論專業(yè)：獲理學(xué)博士學(xué)位。現(xiàn)為遼寧省數(shù)學(xué)與應(yīng)用數(shù)學(xué)示范專業(yè)帶頭人，應(yīng)用數(shù)學(xué)遼寧省重點(diǎn)學(xué)科負(fù)責(zé)人，近年來主要從事最優(yōu)化理論及應(yīng)用、生物信息掌中的優(yōu)化問題研究。主持和參加國家自然科學(xué)基金項目、遼寧省教育廳項目七項。已出版專著一部，教材一部，發(fā)表論文四十余篇。

圖書目錄

第0章緒論
0.1 生物信息學(xué)產(chǎn)生的背景
0.2 生物信息學(xué)的研究對象
0.2.1 核酸
0.2.2 蛋白質(zhì)
0.2.3 中心法則和遺傳密碼
0.3 生物信息學(xué)的主要研究內(nèi)容
0.3.1 序列比較
0.3.2 計算機(jī)輔助基因識別
0.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
0.3.4 RNA和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)研究
0.4 本書的主要內(nèi)容
參考文獻(xiàn)
第1章生物大分子的圖形表示
1.1 引言
1.1.1 DNA序列的圖形表示
1.1.2 RNA二級結(jié)構(gòu)的圖形表示
1.1.3 蛋白質(zhì)序列的圖形表示
1.2 DNA序列的3－D圖形表示
1.3 DNA序列的2－D圖形表
1.3.1 特征序列
1.3.2 基于特征序列的“雙水平線”圖
1.3.3 基于特征序列的“梯狀”圖
1.4 有向圖表示
參考文獻(xiàn)
第2章生物序列的數(shù)值刻畫
2.1 引言
2.2 偽跡
2.3 ALE－指標(biāo)
2.3.1 ALE－指標(biāo)
2.3.2 性質(zhì)
2.3.3 應(yīng)用
2.4 上三角矩陣表示
2.4.1 序列不變量的相容性
2.4.2 有向圖及上三角矩陣的應(yīng)用
2.5 正規(guī)化相對熵
2.5.1 定義
2.5.2 應(yīng)用
參考文獻(xiàn)0
第3章序列與結(jié)構(gòu)的粗粒化描述
3.1 DNA序列的邏輯表示
3.1.1 邏輯表示同其他表示的比較8
3.1.2 邏輯序列的SS矩陣及其壓縮矩陣
3.2 蛋白質(zhì)序列的邏輯表示
3.2.1 蛋白質(zhì)序列的邏輯表
3.2.2 應(yīng)用
3.3 基于5字母模型的蛋白質(zhì)序列的圖形表示及應(yīng)用
3.3.1 氨基酸的5－字母模型
3.3.2 蛋白質(zhì)序列的2－D圖形表
3.3.3 蛋白質(zhì)序列的數(shù)值刻畫
3.3.4 冠狀病毒的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 LZ復(fù)雜度及應(yīng)用
3.4.1 有限序列的LZ復(fù)雜度
3.4.2 基于LZ復(fù)雜度的RNA二級結(jié)構(gòu)相似性分析
3.4.3 廣義LZ復(fù)雜度及應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第4章蛋白質(zhì)編碼基因識別
4.1 引言
4.2 DNA序列基于正規(guī)化相對熵的數(shù)值刻畫
4.3 Fisher線性判別法
4.4 算法的評估
4.4.1 敏感度、特異性和準(zhǔn)確度的定義
4.4.2 算法的評估
4.5 識別釀酒酵母基因組2－6類中的基因
參考文獻(xiàn)
結(jié)語