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內(nèi)容簡介

　　本書較為系統(tǒng)全面地介紹了生物信息學(xué)分析各個方面的軟件用法，結(jié)合光盤具體實例，方便使用。全書共分8章，內(nèi)容包括：Unix／Linux操作系統(tǒng)介紹，介紹了基本的Unix／Linux操作命令；數(shù)據(jù)的基本處理，介紹了如何處理常用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)；序列的比對，介紹了常用比對軟件的用法及其在應(yīng)用過程中要注意的問題；基因組／基因的注釋，介紹了Coding和．Non-Codoing基因的預(yù)測方法；SNP分析，介紹了常用的從生物學(xué)數(shù)據(jù)中尋找SNP的軟件；進(jìn)化分析專題，介紹了幾種分子進(jìn)化分析軟件，內(nèi)容涉及進(jìn)化樹的構(gòu)建、Ka／Ks的計算等；基因表達(dá)分析專題，介紹了EST、及生物芯片分析的流程和方法；蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測，介紹了蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測的流程及方法。本書適合于生物信息學(xué)專業(yè)本科生及研究生使用。

作者簡介

暫缺《常用生物數(shù)據(jù)分析軟件》作者簡介

圖書目錄

序
前言
第1章 Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹
1.1 遠(yuǎn)程登錄
1.2 文件的復(fù)制、刪除和移動命令
1.3 目錄的創(chuàng)建、刪除及更改目錄命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本處理命令
1.6 改變文件或目錄的權(quán)限命令
1.7 備份與壓縮命令
1.8 磁盤及系統(tǒng)管理
1.9 軟件安裝簡介
1.10 其他
第2章數(shù)據(jù)的基本處理
2.1 數(shù)據(jù)常用格式介紹
2.2 測序原理介紹
2.3 華圖轉(zhuǎn)化（Phred）
2.4 文件轉(zhuǎn)換（phd2fasta）
2.5 載體屏蔽（cross_match）
2.6 序列聚類拼接
2.7 Consed
2.8 引物設(shè)計（Primer3）
主要參考文獻(xiàn)
第3章序列的比對
3.1 全局比對
3.2 局部比對
主要參考文獻(xiàn)
第4章基因組/基因的注釋
4.1 重復(fù)序列分析
4.2 RNA分析
4.3 基因預(yù)測
4.4 基因功能注釋
主要參考文獻(xiàn)
第5章 SNP分析
5.1 Polyphred
5.2 SNPdetector
5.3 cross_match
主要參考文獻(xiàn)
第6章進(jìn)化分析專題
6.1 Phylip
6.2 Paml
6.3 KaKs_Calculator
6.4 FGF
6.5 MEGA
主要參考文獻(xiàn)
第7章基因表達(dá)分析專題
7.1 EST表達(dá)序列標(biāo)簽分析
7.2 生物芯片分析
7.3 Motif預(yù)測
主要參考文獻(xiàn)
第8章蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)知識介紹
8.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法
8.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的Threading方法
8.4 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測流程介紹
主要參考文獻(xiàn)