核酸生物化學(xué)

第一章 核酸的高級結(jié)構(gòu) 第一節(jié) 概述 第二節(jié) DNA的二級結(jié)構(gòu) 一、DNA堿基組成的規(guī)律性 二、X射線衍射分析和Watson-Crick模型 三、左旋DNA(Z-DNA) 四、DNA的可變構(gòu)象及其生物學(xué)功能 第三節(jié) DNA的變性 一、溫度對DNA變性的影響 二、pH對DNA變性的影響 三、堿基組成對DNA變性的影響 四、離子強(qiáng)度對DNA變性的影響 五、有機(jī)試劑對DNA變性的影響 六、其他理化因素對DNA變性的影響 第四節(jié) 環(huán)狀DNA 第五節(jié) 核糖核酸的高級結(jié)構(gòu) 一、RNA的結(jié)構(gòu) 二、tRNA的二級結(jié)構(gòu)(三葉草模型) 三、tRNA的三級結(jié)構(gòu) 四、mRNA第二章 DNA和染色體 第一節(jié) 概述 第二節(jié) 從DNA到染色體的組裝 一、染色體涂色技術(shù)和染色體顯帶技術(shù) 二、基因在染色體上的排列 三、人類基岡組的解讀 四、染色體形態(tài)結(jié)構(gòu)在細(xì)胞周期中的變化 五、從DNA到30nm染色質(zhì)纖維的組裝 第三節(jié) 染色體的高級結(jié)構(gòu) 一、燈刷染色體 二、多線染色體 三、有絲分裂染色體 四、常染色質(zhì)和異染色質(zhì) 五、染色體在細(xì)胞核中的定位第三章 物理圖譜的構(gòu)建 第一節(jié) 限制性內(nèi)切核酸酶 一、細(xì)菌的限制修飾作用和限制性內(nèi)切核酸酶的發(fā)現(xiàn) 二、限制性內(nèi)切核酸酶的命名 三、限制性內(nèi)切核酸酶的種類與特性 四、識別位點(diǎn)的序列測定 五、限制修飾性酶對核苷酸序列的識別機(jī)制 六、限制一修飾性系統(tǒng)基因的克隆 七、影響限制性內(nèi)切核酸酶活性的因素 第二節(jié) 構(gòu)建物理圖譜的克隆載體 一、質(zhì)粒載體 二、柯斯質(zhì)粒 三、酵母人工染色體(YAC) 四、細(xì)菌人工染色體(BAC) 第三節(jié) 基因組研究的有關(guān)圖譜 一、遺傳圖譜 二、物理圖譜 三、序列圖譜 四、基因圖譜 第四節(jié) 構(gòu)建DNA物理圖譜的方法 一、DNA片段的制備與分離 二、限制性內(nèi)切核酸酶降解法 三、部分變性法 四、DNA聚合酶法 五、雜交電鏡法(環(huán)形成法) 六、末端標(biāo)記法 七、分子雜交法第四章 核酸序列分析 第一節(jié) DNA序列分析 一、加減法 二、化學(xué)斷裂法 三、雙脫氧法 四、雙脫氧法的改進(jìn)與發(fā)展 五、DNA序列分析的相關(guān)進(jìn)展 第二節(jié) 序列分析凝膠電泳 一、凝膠電泳在DNA片段分離純化中的應(yīng)用 二、序列分析聚丙烯酰胺凝膠電泳 第三節(jié) 核糖核酸(RNA)序列分析 一、概述 二、測定RNA一級結(jié)構(gòu)的片段重疊法 三、測定RNA一級結(jié)構(gòu)的直讀法第五章 DNA的復(fù)制 第一節(jié) 概述 一、研究DNA復(fù)制的目的 二、歷史的回顧 第二節(jié) DNA復(fù)制的基本規(guī)律和幾種復(fù)制模型 一、半保留復(fù)制 二、幾種復(fù)制模型 三、不連續(xù)復(fù)制 第三節(jié) 參與DNA復(fù)制的幾種主要的酶 一、拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerase) 二、解旋酶(DNA helicase) 三、單鏈結(jié)合蛋白(SSB) 四、引發(fā)酶(DNA primase) 五、DNA聚合酶(DNA polymerase) 六、DNA連接酶(ligase) 第四節(jié) DNA復(fù)制的過程 一、復(fù)制的起始 二、復(fù)制的延伸 三、復(fù)制的終止 四、其他原核生物的復(fù)制體系 五、非基因組DNA的復(fù)制 第五節(jié) 確保DNA復(fù)制準(zhǔn)確性的機(jī)制第六章 遺傳信息的表達(dá) 第一節(jié) 從DNA到RNA(轉(zhuǎn)錄、RNA的生物合成) 一、概述 二、原核生物基因的轉(zhuǎn)錄 三、真核生物基因的轉(zhuǎn)錄 四、非編碼RNA的合成 第二節(jié) 從RNA到蛋白質(zhì)(蛋白質(zhì)的生物合成) 一、概述 二、翻譯的起始 三、肽鏈的延伸和終止 四、新生肽鏈的折疊第七章 基因表達(dá)的調(diào)控 第一節(jié) 概述 一、在多細(xì)胞生物中不同類型細(xì)胞的基因組是相同的 二、不同類型的細(xì)胞所含的蛋白質(zhì)是不同的 三、從DNA到RNA再到蛋白質(zhì)，基因表達(dá)的調(diào)控可以在不同的水平上進(jìn)行 第二節(jié) 基因調(diào)控蛋白 一、基因調(diào)控蛋白的發(fā)現(xiàn) 二、基因調(diào)控蛋白與DNA的識別 三、基岡調(diào)控蛋白的特殊結(jié)合域 四、研究基因調(diào)控蛋白的生化技術(shù) 第三節(jié) 原核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 一、色氨酸操縱子 二、乳糖操縱子 第四節(jié) 真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 一、真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的特點(diǎn) 二、真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的機(jī)理 三、果蠅發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 四、哺乳動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控 第五節(jié) 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控 一、轉(zhuǎn)錄衰減 二、RNA的選擇性剪接 三、RNA修訂(RNA editing) 四、RNA的運(yùn)輸 五、mRNA在細(xì)胞質(zhì)中的定位 六、翻譯調(diào)控第八章 DNA的修復(fù)與重組 第一節(jié) 基因突變 一、突變的類型 二、基因突變的原岡 第二節(jié) DNA的損傷修復(fù) 一、DNA聚合酶的矯正修復(fù) 二、光修復(fù) 三、切除修復(fù)(excision repairs) 四、錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repalr) 五、重組修復(fù)(recombination repair) 六、SOS修復(fù) 第三節(jié) 重組和轉(zhuǎn)座 一、慨述 二、基岡重組的作用機(jī)制 三、轉(zhuǎn)座第九章 核酸的制備 第一節(jié) 核酸制備的基本原理 第二節(jié) 核酸制備的基本方法 一、細(xì)胞的破碎 二、核酸提取的基本方法 三、核酸的濃縮和沉淀 四、核酸的純化 五、超離心技術(shù)在核酸分離中的應(yīng)用 第三節(jié) DNA的制備 一、細(xì)菌DNA制備 二、質(zhì)粒DNA的分離純化 三、動(dòng)物DNA的制備 四、植物DNA的制備 五、病毒DNA的制備 第四節(jié) RNA的制備 一、慨述 二、制備RNA的一般方法 三、mRNA的制備 四、tRNA的制備 第五節(jié) 核酸的貯存與鑒定 一、核酸的貯存 二、核酸的含量測定 三、核酸的純度估測 四、核酸凝膠電泳主要參考文獻(xiàn)名詞略語索引