RNA干擾（原理與應(yīng)用）

序言
前言
第1部分 RNA干擾理論
1 RNA干擾的發(fā)展歷史與意義
1.1 RNAi的發(fā)現(xiàn)
1.2 RNAi的意義
2 微小RNA概述
2.1 miRNA的發(fā)現(xiàn)過(guò)程
2.2 miRNA的生物學(xué)特征
2.3 miRNA的基因組學(xué)
2.4 miRNA的成熟及效應(yīng)過(guò)程
2.5 miRNA的功能
2.6展望
3 依賴于RNA的RNA聚合酶
3.1.RdRP在基因沉默中作用的發(fā)現(xiàn)及相關(guān)證據(jù)
3.2 RdRP的生化物理性質(zhì)及其晶體結(jié)構(gòu)
3.3 RdRP與RNA病毒
3.4 RdRP和RNA沉默
3.5降級(jí)性PCR、過(guò)渡性RNAi及系統(tǒng)性RNAi
3.6 RdRP作用過(guò)程中的問(wèn)題
4 微處理器
4.1微處理器的相關(guān)蛋白成分及其對(duì)miRNA的加工
4.2 pre—miRNA從細(xì)胞核輸出的過(guò)程
5 干擾性小RNA產(chǎn)生的關(guān)鍵性蛋白——Dicer
5.1DCR的發(fā)現(xiàn)背景
5.2DCR的一般生化屬性及相關(guān)生物學(xué)功能
5.3DCR的作用方式及在不同生物體中的作用
5.4DCR作用的底物——dsRNA及pre—miRNA的特征及來(lái)源
5.5DCR的加工產(chǎn)物——siRNA和miRNA
5.6不同生物體中DCR的同源物及其基因
6 RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體
6.1RISC的發(fā)現(xiàn)背景
6.2參與RISC組裝的小RNA分子及其可能的組裝模式
6.3RISC的主要成分——AGO蛋白
6.4R[SC在果蠅體內(nèi)的組裝模型
6.5RNAi的剪切模型
6.6RISC指導(dǎo)的靶向性剪切的動(dòng)力學(xué)研究
6.7參與RISC組裝及效應(yīng)過(guò)程的相關(guān)蛋白質(zhì)及影響因子
6.8 RISC的功能
6.9小結(jié)與展望
7 細(xì)胞核內(nèi)的RNA干擾途徑
7.1RNA指導(dǎo)的DNA甲基化
7.2RNAi和異染色質(zhì)的形成
7.3RNAi和DNA切除
7.4減數(shù)分裂I生沉默、配對(duì)和RNAi
7.5細(xì)胞核內(nèi)RNAi途徑的作用方式
7.6其他生物體中的相關(guān)機(jī)制
7.7小結(jié)與展望
第2部分 RNA干擾技術(shù)原理與方法
8 siRNA或dsRNA的設(shè)計(jì)與篩選策略
8.1重組質(zhì)粒方法篩選siRNA
8.2高通量篩選siRNA的微陣列方法
9化學(xué)方法合成siRNA
9.1 2’一tBDMS方法
9.2 2’一TOM方法
9.3 2’一ACE方法
10 siRNA的體外轉(zhuǎn)錄及生物合成方法
10.1PCR siRNA合成法
10.2T7 RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄法
10.3應(yīng)用重組人Dicer體外合成siRNA
11 基因工程方法制備siRNA
11.1表達(dá)元件的構(gòu)建
11.2載體構(gòu)建
12 siRNA的實(shí)驗(yàn)技術(shù)方法
12.1siRNA的體外合成及轉(zhuǎn)染方法
12.2體外轉(zhuǎn)錄制備dsRNA
12.3基因工程方法制備siRNA及轉(zhuǎn)染細(xì)胞的方法
12.4 RNAi在其他生物體中的應(yīng)用研究方法
13 miRNA的實(shí)驗(yàn)技術(shù)方法
13.1miRNA的提取
13.2miRNA克隆
13.3miRNA分子雜交檢測(cè)技術(shù)——Norlthern印跡
第3部分 RNA干擾的應(yīng)用研究
14 RNA干擾在研究基因組功能方面的應(yīng)用
14.1動(dòng)植物中的RNAi
14.2 RNAi在線蟲全基因組功能研究中的應(yīng)用
14.3 RNAi在果蠅研究方面的應(yīng)用
14.4 RNAi技術(shù)在錐蟲研究中的應(yīng)用
14.5 PTGS在植物基因及基因組功能方面的研究
15.RNA干擾在研究胚胎發(fā)育方面的應(yīng)用
15.1 RNAi在小鼠卵母細(xì)胞和胚胎中的應(yīng)用
15.2 RNAi在鳥類胚胎發(fā)育中的研究
16 RNA干擾在抗病毒研究中的應(yīng)用
16.1 RNAi抗HIV_1病毒感染
16.2 RNAi抗禽類逆轉(zhuǎn)錄病毒感染
16.3 RNAi抗肝炎病毒感染
16.4 RNAi抗流感病毒感染
16.5 RNAi抗SARS相關(guān)冠狀病毒感染
16.6 RNAi抗輪狀病毒感染
17 RNA干擾在腫瘤研究中的應(yīng)用
17.1 目前常用的腫瘤相關(guān)基因功能的研究方法
17.2 RNA在腫瘤生物學(xué)中的應(yīng)用
17.3 RNAi在基因治療中遇到的主要問(wèn)題
18 RNA干擾在其他領(lǐng)域的治療研究
18.1 RNAi在心血管疾病中的應(yīng)用研究、
18.2 RNAi在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的應(yīng)用研究
18.3 RNAi在內(nèi)分泌系統(tǒng)疾病中的研究進(jìn)展
18.4 RN～在自身免疫性疾病中的應(yīng)用研究
18.5 RNAi在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用前景
索引