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內(nèi)容簡介

　　隨著人類和模式生物基因組測序工作的迅速發(fā)展，有關(guān)核酸、蛋白質(zhì)序列的結(jié)構(gòu)與功能的數(shù)據(jù)與時(shí)呈指數(shù)俱增?；谏锛夹g(shù)和信息技術(shù)的融合，對這些海量生物學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)手處理、分析，有助于闡明和解讀基因組數(shù)據(jù)中所包含的生物學(xué)意義，從中發(fā)現(xiàn)重大生命科學(xué)的規(guī)律，揭示生命奧秘，這將是基因組學(xué)這門新興的交叉學(xué)科所承擔(dān)的重要任務(wù)。掌握基因組數(shù)據(jù)分析方法是解開生命奧秘的鑰匙。本手冊從大規(guī)模基因組測序入手，順沿基因組數(shù)據(jù)的產(chǎn)生、儲(chǔ)存、檢索和分析這條線索，依次介紹了測序分析軟件（Phred-Phrap-Consed）、　序列同源性聯(lián)配分析工具（BLAST、SlM4、CLUSTALW）和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測，以及蛋白質(zhì)序列功能注釋、分類和代謝途徑分析等軟件的功能和用法，此外，還介紹一些網(wǎng)絡(luò)公共數(shù)據(jù)庫資源和杭州華大基因研發(fā)中心研制的EST序列分析系統(tǒng)。初學(xué)者可“對號(hào)入座，各取所需”。本手冊既可作為從事生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等領(lǐng)域的科研及教學(xué)人員的工具書，也可作為大學(xué)生和研究生的實(shí)習(xí)指導(dǎo)用書。本手冊可以幫助讀者初步掌握基因組數(shù)據(jù)分析的方法，并為他們學(xué)習(xí)基因組學(xué)導(dǎo)航。

作者簡介

暫缺《基因組數(shù)據(jù)分析手冊》作者簡介

圖書目錄

第1章大規(guī)?；蚪M測序策略與技術(shù)
1.1 大規(guī)模基因組測序的常用技術(shù)
1.2 大規(guī)模測序的策略
1.3 逐步克隆法測序策略
1.4 全基因組霰彈法測序策略
1.5 大規(guī)?；蚪M測序的現(xiàn)狀與發(fā)展趨勢
第2章生物信息數(shù)據(jù)庫
2.1 文獻(xiàn)檢索
2.2 核酸序列數(shù)據(jù)庫檢索
2.3 基因組序列數(shù)據(jù)庫檢索
2.4 氨基酸序列數(shù)據(jù)庫
2.5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫PDB
2.6 疾病相關(guān)基因數(shù)據(jù)庫
第3章序列聯(lián)配(BLAST、slM4)
3.1 Blast
3.2 Sim4
第4章多序列聯(lián)配(Clustal W)
4.1 C1ustal簡介
4.2 目的
4.3 原理
4.4 步驟
4.5 結(jié)果及分析
第5章測序分析軟件(Phred／Phrap／Consed)
5.1 Phred堿基讀取程序
5.2 Phrap序列組裝程序
5.3 Consed圖形化視圖
第6章 EST序列分析系統(tǒng)
6.1 EST通道化分析系統(tǒng)(EST Analysis Pipeline System TM)
6.2 用戶登錄
6.3 主界面和界面說明
6.4 模塊功能列表
第7章蛋白質(zhì)序列的功能注釋、分類和代謝途徑分析
7.1 蛋白質(zhì)序列的功能注釋
7.2 蛋白質(zhì)序列的功能分類
7.3 蛋白質(zhì)序列的代謝途徑分析
7.4 蛋白質(zhì)序列綜合注釋示例
第8章 ORF的搜尋及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.1 ORF的搜尋
8.2 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.3 用Swiss-model進(jìn)行蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測
8.4 用PROSPECT進(jìn)行蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測
第9章華大基因研發(fā)中心網(wǎng)絡(luò)資源
9.1 BTN簡介
9.2 PASDB簡介
9.3 RICE GD簡介
9.4 UNIBLAST簡介
9.5 HGP簡介
9.6 TTEN簡介
第10章 Bioperl 簡介